Im Sommer 1941 starben zuerst diejenigen Patientinnen und Patienten, die auf Grund des oben genannten Stops am 24. August 1941 nicht mehr aus den Zwischenanstalten in eine Gasmordanstalt weitertransportiert wurden. Vor dem Hintergrund der zunehmenden Luftangriffe der Alliierten erfolgte in großem Umfang die Deportation von Kranken und Behinderten in weniger gefährdete Gebiete, um die ursprünglichen Anstalten als Ausweichkrankenhäuser für die Zivilbevölkerung nutzen zu können („Aktion Brandt“). Infolge der Deportationen waren die aufnehmenden Anstalten bald überlastet und „lösten“ dieses Problem durch die Ermordung von Patienten in einer als erforderlich erscheinenden Zahl.

Die Zahl der Opfer der dezentralen „Euthanasie“ wird nie mehr genau zu bestimmen sein. Schätzungen gehen von bis zu 200.000 Toten aus.